固相合成法對于多肽合成具有顯著的優點：簡化并加速了多步驟的合成，因反應在一簡單反應器皿中便可進行，可避免因手工操作和物料重復轉移而產生的損失，固相載體共價鍵聯的肽鏈處于適宜的物理狀態，可通過快速的抽濾 洗滌來完成中間的純化，避免了液相肽合成中冗長的重結晶或分離步驟，可避免中間體分離純化時大量的損失，使用過量反應物，使反應進行完全，以便Z終產物得到高產率，增加溶劑化，減少中間產物，固相載體上肽鏈和輕度交聯的聚合物鏈緊密聯系，彼此產生一種相互的溶劑化效應，這是肽鏈自聚集熱力學不利而對反應適宜。
多肽合成載體的選擇使合成多肽基礎也是關鍵的步驟，因而了解多肽合成樹脂的結構與性質的關系，從而對樹脂進行改進或者設計 合成新型的多肽載體，使反應更迅速，更趨于均相，提高多肽的純度。
